En los terrenos en los que se encuentra actualmente la escuela, inicia sus actividades el 13 de Febrero de 1973 con el nombre de "Escuela Normal Preparatoria Popular del Soconusco", estando como director en ese entonces el Lic. Jesús Marcelín Solís.
En el año de 1977 el Ayuntamiento hace entrega oficialmente de los terrenos de la escuela, siendo en ese entonces Secretario de Ayuntamiento el C. Daniel Garcia Albores, en el mismo año, el 1 de Diciembre queda a cargo de la dirección la C. Esperanza Maldonado Hernández, a quien el 1 de Septiembre de 1978 le autorizan el cambio de Nombre de la escuela a "Escuela Normal Valentín Gomez Farias".
Para el año de 1982 el Profr. Ignacio Corona Hernández solicita el 4 de Noviembre la construcción del edificio para la "Escuela Normal Valentín Gomez Farias"
Para el año de 1986 se da de baja la clave de la "Escuela Normal Valentín Gomez Farias", por lo que desaparece dicha institución quedando sin lugar de adscripción el personal docente y administrativo, así mismo, tomando en cuenta la demanda de alumnos de nivel medio superior quienes quedaban sin lugar en otras escuelas preparatorias, se decide llevar a cabo la creación de la "Escuela Preparatoria del Estado #3", siendo el fundador el Lic. Ulises Cerdio Cortes, quien en el año de 1987 solicita a la Secretaria de Educación y Cultura la construcción de la primera etapa de la escuela.
El 11 de Octubre de 1988 hace entrega el Lic. Ulises Cerdio Cortes quien estuvo a cargo de la dirección desde 1986 y hasta 1988 al Lic. Juan de Jesús Lazos Fong, año en el que se funda el turno vespertino de la escuela, para el ciclo escolar 2000-2002 se funda el Turno Matutino.
La generación del ciclo escolar 2001-2002 empieza con el nuevo plan de Estudios BAPPEMS (Bachillerato Propedeutico y Profesional de Educación Media Superior), el cual integra un tronco común, este se compone de dos fases:
Introductorio: Primero y Segundo Semestres.
Profundizacion: De tercer a Sexto Semestre, en donde en los semestres Quinto y Sexto se lleva a cabo la fase de especialización, en las áreas de: Fisico Matematicas, Ciencias Sociales y Humanidades y Quimico Biologicas, para esas fechas, actualmente se cuenta también con el área de Economico Administrativas.
El 25 de Marzo del año 2009 se lleva el cambio del Director de la escuela, dejando dicho puesto el Lic. Juan de Jesús Lazos Fong al Lic. Miguel Angel Coronel Mellanes quien actualmente sigue fungiendo como director de la Escuela Preparatoria del Estado #3.
Elaborado por: Ing. Moisés Hernández Villatoro
Con la colaboracion de: Ing. Maria Eugenia Gill
Bibliografia:
ANTECEDENTES HISTORICOS DE LA INSTITUCION
Autores: Cristian omar Méndez Gonzáles
Luis Fernando Aguilar
Julius Erwin Gordillo Coutiño
Luis Daniel Cigarroa López
Daniela Chacón Cruz
Son Hechos no Palabras 
